Każdy gracz, pragnący kontynuować wątek główny, będzie musiał zdecydować kim chce zostać w Świecie Gothic II, a co za tym idzie w końcu dołączyć do jednej z trzech gildii. Zachowanie NPC względem naszej postaci będzie zależne od aktualnej rangi w naszej gildii oraz samego członkostwa w niej. Przyłączając się do jakiejkolwiek z owych organizacji posiądziemy możliwość zdobycia specjalnych dla naszej postaci umiejętności oraz możliwość rozwijania ich. Zdobycie i rozwijanie niektórych umiejętności, które nie są w kręgu naszych głównych zdolności, będzie kosztowało nas więcej Punktów Nauki, niektórych w ogóle się nie nauczymy.

W Gothic II możemy dołączyć do trzech dużych organizacji - Strażników Miejskich , Nowicjuszy oraz Najemników, z których wraz z biegiem gry będziemy mogli awansować na - Paladyna, Maga Ognia i Łowcy Smoków.

Strażnik Miejski / Paladyn
Wielu początkujących graczy wybiera najczęściej te ścieżkę, robią to może dlatego z samego powodu spotkania ich na początku gry, lub zawikłania fabuły w ich gildie, wielu też marzy od zdobyciu lśniącej zbroi Paladyna, a jedyny sposób to właśnie dołączenie do tej gildii. Ta klasa nie jest specjalistą w danej dziedzinie ważne jest tu rozłożenie odpowiednio Punktów Doświadczenia. Paladyni walczą wszelakiej maści orężem ,i posługują się runami, specjalnymi dla ich gildii (jak i zwykłymi, niektóre runy mogą być używane tylko przez Magów Ognia), nie osiągają jednak Mistrzostwa w żadnej z tych dziedzin. Paladyni to elitarna grupa rycerzy króla Rhobara II (w legendach rycerze okrągłego stołu) ,zostali wysłani do Khorinis by zebrać cenną Magiczną Rudę ,dzięki której można wykuć potężne uzbrojenia niemal ,że niezniszczalne na wojnę z Orkami. W Mieście Khorinis Paladynami dowodzi Lord Hagen, a jego prawą ręką jest Lord Andre, zaś Górniczej Dolinie, w Zamku w którym ongiś przebywał Gomez spotkamy Paladynów pod przywództwem Garonda. Jako Paladyn musimy liczyć się z nastawieniem chłopów i Najemników do nas.

Najemnik / Łowca Smoków
Jeśli twoim atutem nie jest magia, a wolisz działać niż myśleć, to ta gildia będzie dla ciebie najlepsza. Wyjadacze Gothic I kierują tutaj swoje pierwsze kroki, ze względu na możliwość spotkania starych znajomych z pierwszej części. Do Najemników dołączymy na farmie Onara, u Lee. Członkowie tej gildii specjalizują się we wszelakim uzbrojeniu ,od różnorakich broni siecznych, po bronie dystansowe, takie jak kusze czy łuki, rzadko jednak używają magii, a gdy to robią, są to przeważnie zwoje. Dołączając do Najemników na Farmie Onara, posiądziemy jak w przypadku Paladyna specjalne dla naszej postaci umiejętności, w tym przypadku, będą to typowo zdolności Bojowe, zatracimy jednak całkowicie możliwość tworzenia i korzystania z run. Najemnicy to grupa towarzyszy Lee, który zebrał ich ,gdy Bariera upadła, przybył na Farmę Onara, gdzie zawarł z nim pakt, ma chronić jego oraz podlegające mu farmy przed Strażnikami Miejskimi, którzy liczyli na dodatkowe zyski z poza murów Khorinis. Dodam, że nie będziemy cieszyć się dużą przyjaźnią mieszkańców miasta Khorinis i Paladynów.

Nowicjusz / Mag Ognia
Wielu na początku pragnie zostać Magiem Ognia, lecz nie wielu się to udaję, by stać się sługą Innosa, trzeba złożyć w Klasztorze ofiary, w postaci Owcy i 1000 sztuk złota, z tego powodu większość początkujących graczy zniechęca się. Gdy dołączymy do Klasztoru, po kilku mniejszych zadaniach staniemy (ale, nie tylko my) przed obliczem wielkiej rady ,w której skład wchodzą - Serpentes, Ulthar i Arcymag Klasztoru Pyrokar, każdy członek zleci nam po jednym zadaniu., tylko ten kto przejdzie pomyślnie wszystkie próby będzie godzien zostać Magiem Ognia. Jako Mag Z biegiem gry, będziemy poznawać jasne ,jak i mroczne strony magii, będziemy musieli nauczyć się 6 kręgów magicznych, które określają nasze zaawansowanie w dziedzinie sztuk magicznych, wraz z wyższa ilością kręgów, będą pojawiać się coraz potężniejsze runy z zaklęciami. Magowie Ognia służą Innosowi ,bogowi Płomieni i Sprawiedliwości, Innos powołał też Paladynów "Rycerzy za wiarę". Na początku można mieć problemy z przeciwnikami, ponieważ Magowie nie radzą sobie najlepiej w walce wręcz. Jako mag będziemy powszechnie szanowani,  bierze się to z pewnego lęku przed wybrańcami Innosa.